厦门大学附属中山医院眼科是集医疗、教学、科研和防盲治盲为一体、设施完善、技术力量雄厚的科室。目前拥有专业医护及医技人员24人，设有白内障、玻璃体视网膜、青光眼、视光与小儿斜弱视、眼表、泪器及眼眶亚专业组，各亚专业组长均在国内知名眼专科进修学习，特别是引进了玻璃体视网膜疾病及眼表方向的博士研究生，进一步提升了科室的综合实力。

科室配备有各种先进的眼科专业检查及手术治疗设备，包括了最新一代德国蔡司的超广角眼底照相机及血管造影检查仪、视野计、海德堡光学相干断层扫描仪、德国Oculus干眼综合分析、蔡司眼底激光及眼前段激光治疗、干眼雾化熏蒸等一系列眼科检查及治疗设备。同时拥有新一代蔡司显微镜、爱尔康玻璃体切割超声乳化一体机、蔡司广角镜等高端眼科手术设备。诊治的疾病种类覆盖眼科常见病、疑难病和危重病。常年开展超声乳化联合人工晶体植入手术治疗各类白内障;玻璃体切割手术治疗玻璃体积血、视网膜脱离、黄斑前膜及黄斑裂孔、眼外伤、球内异物、眼内炎等复杂玻璃体视网膜疾病;常规开展抗青光眼手术、泪道手术、眼眶、眼整形、斜视等手术。开展激光治疗眼前后节疾病多年。在厦门大学附属中山医院医疗实力雄厚的综合医院的平台上，眼科与多学科合作密切，尤其在糖尿病相关眼病的早期筛查与治疗、各系统疾病眼部并发症的处理上实现系统性治疗，并积累了丰富的诊治经验；常年承担厦门大学医学院及厦门医学院的眼科学带教工作。